Trilobitter: Disse utdødde marine leddyrene er vidt utbredt i Pyreneene. De trivdes under paleozoikum, fra den kambriske perioden til den devonske perioden. Trilobittfossiler kan finnes mange steder, for eksempel de kambriske skifrene nær Gavarnie i Frankrike, og i de ordoviciske kalksteinene i Vallibierna-området i Spania.
Ammonitter: Ammonitter er utdødde blekkspruter, relatert til moderne blekksprut og blekksprut. De finnes ofte i de mesozoiske bergartene i Pyreneene, spesielt i jura- og krittperioden. Fossiliserte ammonitter kan observeres i kalksteiner og mergel på steder som Col de Ares i Frankrike og Sierra del Montsec i Spania.
Echinoids (kråkeboller): Echinoider er marine virvelløse dyr med piggete skjell. Fossilene deres er utbredt i Pyreneene, fra paleozoikum til tertiærperioder. De kan finnes i grunne marine avsetninger som kalksteinene fra kritt i Roncal-området i Spania.
Rudistmuslinger: Rudistmuslinger var rikelig under den sene krittperioden. De er store og ofte bisarre i form, og danner revstrukturer i enkelte områder av Pyreneene. Fossiliserte rudister kan observeres på steder som Gavarnie Gorge og Luz-Saint-Sauveur-området i Frankrike, samt i Ordesa og Monte Perdido nasjonalpark i Spania.
Tall: Nummulitter er utdødde encellede foraminiferer som levde i varmt, grunt hav. Nummulittfossiler er vanlige i eocene kalksteiner i Pyreneiske regionen, spesielt i Hecho-området i Spania og regionen rundt Pau og Mauléon i Frankrike.
Oligocene pattedyr: Pyreneene har også gitt viktige pattedyrfossiler fra Oligocene-epoken, som restene av tidlige primater, gnagere og rovdyr, og gir innsikt i den tidlige utviklingen av disse gruppene.
Dette er bare noen få eksempler på de forskjellige fossilene som finnes i Pyreneene. Den komplekse geologiske historien og miljøforholdene i fjellkjeden har resultert i en rik og viktig paleontologisk arv som fortsetter å tiltrekke seg forskere og forskere fra hele verden.