Glukosamin er generelt trygt, men kan gi bivirkninger som kvalme, diaré, forstoppelse, bløtning, gass, hodepine, søvnighet, og hudutslett.
Medisinske interaksjoner: Det kan interagere med warfarin, insulin og diabetesmedisiner, og methotrexat.
Forsiktighetsmåltak: Folk med diabetes, nyresykdom, leversykdom, blødningssykdommer, eller sjømatallergi bør konsultere lege. Det anbefales ikke under graviditet, amming, eller for barn under 18 uten medisinsk råd.