Det finnes flere kaninarter som anses enten sårbare eller i fare for utdøing og er på Internasjonale naturvernunionens «Rødliste», som inkluderer navnene på verdens mest truede dyr. Sammen med denne listen er det informasjon om tiltak som blir tatt for å redne disse artene.
Sumatransk striped kanin
Den sumatranske striped kaninen anses som en sårbar art av IUCN og finnes bare i spesifikke levesteder over 1 968 fot over havet. Den er hjemmehørende på Sumatra og lever i små antall på det fjerne sørvestlige hjørnet av øya. Avskoging for kaffeplantasjoner er angitt som en grunn til kaninens synkende populasjon. Forskning er nødvendig for å vurdere nøyaktige tall for arten for mulig klassifisering som truet.
Amami-kanin
Amami-kaninen anses som truet og er hjemmehørende til de små japanske øyene Amami-Oshima og Tokuno-Shima. I 2004 var populasjonen på Amami-Oshima mellom 2 000 og 4 800 kaniner. Artene tall er på nedgang på grunn av innførte rovdyrdyr og avskoging.
Vulkankanin
Vulkankaninen er hjemmehørende til bare fire brennende vulkanområder i Mexico. Med kaninens levested så nærme den voksende byspredningen i Mexico City og de omkringliggende jordbruksområdene, er mye av dets naturlige levested ødelagt. Bevaringsinnsatser har hjulpet arten til å begynne en langsom gjenoppreising, men den er fortsatt i fare. Denne arten anses som truet.
Tres Maria's cottontail
Tres Maria's cottontail er hjemmehørende til de fire Tres Maria's øyene utenfor vestkysten av Mexico. Den nyeste undersøkelsen utført i 1987 fant kaniner bare på én av øyene, San Juanito. Populasjonsnedgangen er knyttet til innføring av husdyr som svin og geiter samt husrotter. Jakt av mennesker påvirket også denne truede arten.
Omilteme cottontail
Omilteme cottontail-kaninen er en ekstremt sjelden art som allerede kan være utdødd. Kaninens levested er et lite område nær Omilteme, Mexico. Bare tre levende prøver har noen gang blitt registrert, og den siste registreringen var en kaninskinn innkjøpt fra jaktfolk i 1998. Skogdrift og utvidende jordbruksland har begge mindsket artens naturlige levested.