Fruktflaggermus bruker flere forsvar:
- Ekkolokasjon: Oppdager hinder og rovdyre ved hjelp av lyd.
- Flyvning: Rask manøvrering hjelper dem å rømme fare.
- Kamouflasje: Mørk pels blander seg med nattens himmel.
- Sosial atferd: Store kolonier gir sikkerhet i tall.
- Forsvarsmekanismer: Ugjernende lukter, vokaliseringer, eller bitt skrekker trusler.
- Habitatvalg: Skoger og huler gir skjul.
- Rovdyre-unngåelse: Justering av mate-mønstre for å unngå farlige områder.
- Trekking: Noen arter trekker for å rømme predasjon eller harde forhold.