2. Krypskyting og jakt: Bonoboer blir jaktet på for kjøttet deres og noen ganger for ulovlig kjæledyrhandel. Bushmeat-handelen utgjør en alvorlig trussel, med bonoboer som blir drept for kjøttet og solgt på lokale markeder.
3. Sykdomsoverføring fra mennesker: Nærhet til menneskelige populasjoner kan også påvirke bonoboer på grunn av sykdomsoverføring. Smittsomme sykdommer, som luftveisinfeksjoner og ebolavirus, kan være dødelige for menneskeaper, inkludert bonoboer.
4. Begrenset rekkevidde: Bonobos har et relativt lite naturlig utbredelsesområde sammenlignet med andre store apearter, hovedsakelig begrenset til Kongo-bassenget i Den demokratiske republikken Kongo. Denne begrensede rekkevidden gjør dem mer sårbare for konsekvensene av tap av habitat, krypskyting og menneskelige forstyrrelser.
5. Langsom reproduksjonshastighet: Bonobos, som andre store aper, har lang levetid, men en langsom reproduksjonshastighet. Dette betyr at populasjonene deres kommer seg sakte etter virkningene av jakt, sykdom eller tap av habitat, noe som øker risikoen for fare.
6. Mangel på bevissthet: Inntil nylig har bonoboer fått mindre oppmerksomhet og bevaringsressurser enn andre store apearter. Denne mangelen på bevissthet og prioritering har bidratt til deres sårbare status.
Det gjøres innsats gjennom bevaringsorganisasjoner, beskyttede områder, antikrypskyting og bevisstgjøring for å beskytte de gjenværende bonobobestandene og bevare deres habitat. Imidlertid gjør de pågående truslene og den politiske ustabiliteten i Den demokratiske republikken Kongo bevaring av bonobo til en utfordrende bestrebelse.