Utryddelse av rød ekorn ville betydelig påvirke skogøkosystemer der den spiller en nøkkelrolle.
Frøspredning og matnett
Rød ekorn gemmer frø og nøtter, bidrar til skogrejuvenesens og biodiversitet. Deres tap ville fjerne denne spredningsmekanismen og forstyrre rovdyrebestander som er avhengige av dem som bytte.
Konkurranse og kulturell verdi
Der røde og grå ekorn sameksisterer, konkurrerer røde ofte ut grå for ressurser. Uten røde ekorn kunne gråbestander utvides og fordrive andre hjemmehørende arter. Tabet ville også bære kulturelle og estetiske konsekvenser, inkludert effekter på økoturisme og viltobservasjon.