* Forskjeller i genetikk: Deres DNA er betydelig annerledes, og forhindrer vellykket befruktning.
* Fysiske inkompatibiliteter: Deres reproduktive organer er ikke kompatible, noe som gjør fysisk parring umulig.
* atferdsforskjeller: Flygende ekorn er nattlige og arboreale, mens vanlige ekorn er daglige og lever først og fremst på bakken. Disse forskjellene gjør parring usannsynlig selv om de var fysisk kompatible.
Derfor kan et flygende ekorn ikke parre seg med et vanlig ekorn. De er separate arter med distinkte evolusjonsveier.