Det er vanskelig å bestemme det eksakte antallet margays igjen i verden da de er unna å få øye på og befinner seg i fjernområder. Ifølge Internasjonal naturvernunion (IUCN) er margay klassifisert som «Nær truet» på grunn av habitatstap og jakt.
Margaybestanden anses å være på nedgang, og det antas at det kan være færre enn 10 000 kjønnmodne individer igjen i vilt tilstand.