Japans hvalfangstpolitikk har to hovedkomponenter:
1. Vitenskapelig forskningshvalfangst (JARPA)
Gjennomføres under spesielle statslige tillatelser, dette programmet var designet for å samle data om hvalarter som vagehval, sei og finnhval. Likevel dømte Den internasjonale rettshof at Japans antarktiske JARPA II-program ikke var vitenskapelig forskning, noe som førte til at Japan stoppet det. Japan startet senere et nytt program, men rettshofen dømte i 2021 at fortsatt «vitenskapelig hvalfangst» også brøt internasjonale lover.
2. Kystnær hvalfangst for lokal forbruk
Japan driver også småkysthvalfangst rettet mot vagehval langs kysten. Staten setter kvoter, og kjøttet selges lokalt. Naturvernorganisasjoner har utøkt bekymring for bærekraft og vanskelighetene med å overvåke kystnære hvalbestander.