Megalodon ble ikke "formet" i betydningen å være kunstig skapt. Det var en naturlig utviklet haiart som utviklet seg og trivdes i løpet av sin tid. Som alle andre arter ble Megalodons eksistens og egenskaper formet gjennom prosessene med naturlig utvalg og tilpasning til miljøet gjennom millioner av år.
Megalodon utviklet seg fra mindre forfedre innen Otodus-slekten. Over tid opplevde visse arter innenfor denne avstamningen fordelaktige genetiske mutasjoner som gjorde at de kunne vokse seg større i størrelse og utvikle sterkere kjever og tenner, noe som resulterte i fremveksten av Megalodon. Tilgjengeligheten av rike byttedyr og miljøforholdene under miocen- og pliocen-epokene bidro også til suksessen og dominansen til Megalodon i økosystemet.