Komodo -dragen antas å ha utviklet seg fra en forfedres monitor øgle. Monitor øgler er en mangfoldig gruppe øgler som finnes i forskjellige deler av verden, og de er alle nært beslektede. Komodo -drager anslås å ha sin opprinnelse fra Australia for rundt 15 millioner år siden og spredt til øyene i Indonesia da havnivået falt, slik at landbroer kunne danne seg mellom øyene. Da Komodo -dragene bebod sitt nye miljø, tilpasset de og gjennomgikk evolusjonsendringer, noe som førte til den unike arten vi kjenner i dag.