Det Joniske Hav bevarer et rikt marinliv. Pelagiske arter inkluderer makrell, torsk, sverdfisk og bonito. Demersale arter inkluderer havaborre, snapper, havbrasje og kutling. Blekkfisk som blekksprut og blæksprut er vanlige, sammen med haier og roker. Vern er viktig, da mange bestander trues av overfisking og habitattap.