Fisk puster ved å trekke vann over gillene sine. Oksygen diffunderer over tynde kapillær membraner inn i blodstrømmen, mens karbondioksid diffunderer ut. Vann forlater kroppen gjennom gillesegl eller gillelokker. Noen arter har tillegssorganer for å puste luft ved lavt oksygenhold.