Algeblomstringer kan skade akvatiske økosystemer på flere måter:
- Oksygendepleting: Alger blokkerer sollys, reduserer fotosyntese og senker oksygennivåer, som kan kvile fisk og andre organismer.
- Toksinproduksjon: Noen alger utskyller tokskiner som skader nervesystemet, leveren og respiratory organene hos akvatiske dyr og kan akkumulere i næringssettet.
- Habitatforstyrrelse: Overflatalger blokkerer lys og endrer habitater, påvirker neddømte planter og artene som avhenger av dem.
- Næringssettsimpakt: Soden algerikdom kan overvelde primærforbrukere, redusere mat for større fisk, fugler og pattedyr.
- Vannkvalitetsforverring: Fordøyende alger øker biologisk oksygenkrev, ytterligere senker oksygen og skaper skadelige sykluser.
Håndtering av blomstringer krever næringsstoffreduksjon, forbedret vannforvaltning og noen ganger bioremidieringsteknikker.