- Habitat -tap og nedbrytning: Afrikanske pingviner er avhengige av kysthabitater for avl, hekking og fôring, men disse naturtypene trues av menneskelige aktiviteter som kystutvikling, forurensning og overfiske. Spesielt kystutvikling har resultert i ødeleggelse eller fragmentering av hekkeplasser.
- Overfiske: Afrikanske pingviner trues også av overfiske, da de er avhengige av fisk for kostholdet sitt. Overfiske kan redusere tilgjengeligheten av mat for afrikanske pingviner og gjøre det vanskeligere for dem å overleve. Visse fiskearter De afrikanske pingvinene er avhengige av blir overfisket for konsum og rekreasjonsformål.
- Klimaendringer: Klimaendringer er en annen stor trussel mot afrikanske pingviner. Stigende havnivå og endringer i havtemperaturene kan forstyrre pingvinenes avlssyklus, redusere matforsyningen og føre til ødeleggelse av hekkende stedene.
- Forurensning: Forurensning fra forskjellige kilder, inkludert oljesøl, plastavfall og avløpsavløp, kan også ha negative innvirkninger på afrikanske pingviner. Oljesøl kan belegge fjærene, noe som gjør at de ikke kan regulere kroppstemperaturen og vanntette kroppene sine, noe som fører til død. Plastavfall kan inntakes av pingviner og forårsake blokkeringer i fordøyelseskanalene, og avløp av avløp kan forurense matkildene sine.
- predasjon: Afrikanske pingviner står overfor trusler fra rovdyr, både på land og til sjøs. På land kan de bli angrepet av mongooser og katter, mens de er til sjøs, de kan byttes ut av haier og andre store marine rovdyr.
Disse faktorene har alle bidratt til tilbakegangen av afrikanske pingvinpopulasjoner, noe som fører til deres klassifisering som truet av International Union for Conservation of Nature (IUCN). Bevaringsinnsats pågår for å adressere disse truslene og beskytte de gjenværende afrikanske pingvinpopulasjonene.