Mendes ble født i Xapuri, Acre, Brasil. Han begynte å jobbe som gummitapper i en tidlig alder, og på 1970-tallet var han blitt leder av gummitappernes fagforening. Fagforeningen kjempet for bedre arbeidsforhold og lønn for gummitappere, samt for bevaring av Amazonas regnskog.
Mendes arbeid brakte ham i konflikt med mektige grunneiere og tømmerhoggere, som så ham som en trussel mot deres interesser. I 1988 ble han myrdet av bevæpnede menn ansatt av disse grunneierne.
Mendes død trakk internasjonal oppmerksomhet til Amazonas regnskogs og dens urbefolkningers situasjon. Det bidro også til å inspirere etableringen av Chico Mendes Institute for Conservation and Biodiversity, en ideell organisasjon dedikert til å beskytte Amazonas regnskog og dens biologiske mangfold.
Mendes regnes som en helt av mange miljøvernere og sosial rettferdighetsaktivister. Han er en påminnelse om farene som kan stå overfor de som kjemper for å beskytte miljøet og rettighetene til urfolk.