Villrein står overfor flere trusler som kan påvirke deres overlevelse og velvære:
Habitat, sykdom og rovdrift
Habitattap og fragmentering fra menneskelig utvikling reduserer beiteområder og vandringsruter. Sykdom, spesielt lungebetennelse overført fra tam sau og geit, kan forårsake høy dødelighet. Naturlige rovdyr som fjelløve, ulv og coyote påvirker også populasjoner.
Jakt, konkurranse og klima
Regulert jakt kan være bærekraftig, men villejakt og overjakt reduserer tall. Konkuranse med husdyr om beite og vann, sammen med klimadrevne endringer i vegetasjon og vannetilgang, tilsetter press. Menneskelig rekreasjon og utvikling forstyrrer ytterligere deres atferd.
Samarbeidende vern involverende viltforvaltere, organisasjoner og lokale samfunn er essensielt for deres langsiktige bestående.