Coyotter er toppredatorer med svært få naturlige fiender, men noen dyr rovjakter dem:
- Større hundeartede: Ulver, spesielt der utbredelsesområder overlapper
- Bjørner: Svartbjørner og grizzlybjørner
- Fjelløver: Sterke nok til å ta voksne coyotter
- Mennesker: Gjennom jakt, felling og bilulykker
- Andre coyotter: Intraspesifikk predasjon under matsvinn eller territorialkonkurranse
Spesifikke rovdyre varierer etter lokasjon og miljømessige faktorer.