Imidlertid møter de trusler fra en rekke dyr, inkludert:
* Større rovfugler: Ugler, hauk og ørn kan svinge ned på dem på flukt.
* slanger: Noen slanger, som Boas og Pythons, kan jakte dem i sine hylser.
* Andre pattedyr: Opossums, weasels og enda større flaggermus kan bytte på dem.
* mennesker: Selv om det ikke er et naturlig rovdyr, kan mennesker utgjøre en trussel gjennom ødeleggelse av naturtyper og jakt.
Det er viktig å merke seg at vampyr flaggermus er sterkt tilpasset miljøet. De er utmerkede flygeblad, og de bor ofte i store kolonier for ekstra beskyttelse. De har også en rekke andre forsvarsmekanismer, for eksempel å avgi høyfrekvente lyder for å forvirre rovdyr.