Brune pelikaner er økologisk verdifulle på flere måter:
Økologisk rolle: De spiser fisk, og bidrar til å opprettholde balanserte rovfugl-bytte-forhold i marine økosystemer.
Bestandsindikatorer: Som toppredatorer avslører deres helse og bestandsutvikling informasjon om marin miljøs velvære.
Aasetere: De kan spise død fisk, og hjelpe med å fjerne organisk materiale fra farvannene.
Næringsstoffsyklus: Gjennom spising og avføring spredrer de næringsstoffer som støtter fytokplanktonvekst.
Artsmangfoldindikatorer: Deres tilstedeværelse og helse speiler mangfoldet av andre marine arter.
Kulturell betydning: De er symboler for kystøkosystemer i mange regioner.
Estetikk: Deres majestetiske flyvning og stuppekved atferd legger til naturskjønnhet i kystmiljøer.