Ansvarlige tyske schäferhund-opdrettere jobber mot å avle de sundeste av sine hunder som møter standardene satt av grupper som American Kennel Club. Til tross for de beste anstrengelsene fra oppdrettere og eiere, fortsetter mange alvorlige degenerative og arvelige lidelser å bli videreført gjennom blodlinjene. For å stabilisere helsen til denne intelligente rasen, bør alle tyske schäferhund-eiere skjerne for arvelige problemer hunden deres kan ha, før de bestemmer seg for å avle en ny generasjon.
Osteosarkom
Tyske schäferhunder rammes ofte av beinkreft, inkludert osteosarkom. Denne sykdommen starter som en tumor på innsiden av et bein, vanligvis en lem. Tumor vokser utover til beinet er ødelagt, og forårsaker stadig intensivere smerte. Tegn inkluderer lamhet, nakenhet til å trene og økt hevelse og irritabilitet. Behandling må skje raskt for å saktne kreftens vekst. Amputasjon av det rammete leddet og kjemoterapi anbefales. Osteosarkom er en aggressiv sykdom som alltid vil tilbakekomme et annet sted, ofte i lungene. Selv med kjemoterapi, vil de fleste hunder ikke leve lenger enn ett år med denne sykdommen.
Lumbosakral stenose (Cauda equina-syndrom)
Lumbosakral stenose er en nerverkade, forårsaket av artritt i leddet mellom den siste lumbale vertebra og sakrum, en av bekkens bein. Artritten vil skape en fortrengning av kanalen som bærer ryggmargen og nervene. Etterhvert som trykket øker, resulterer det i inkontinens og ofte bakre lemmer lammelse. Symptomer kan dukke opp over mange måneder og presentere som smerte ved avføring eller uevne til å løfte halen. Uten behandling vil beinene bli svake og tynde siden hunden unngår å bruke disse musklene. Selv om streng hvile kan lindring symptomene hos mindre rammete hunder, vil mange tilfeller kreve kirurgi for å lindring smerte og gi en bedre prognose.
Eksokrin pankreasinsuffisiens
Omtrent 70 prosent av tyske schäferhunder mangler et pankreatisk enzym som tillater dem å fordøye maten sin ordentlig i tyntarmen. Denne tilstanden er kjent som Eksokrin Pankreasinsuffisiens (EPI) og resulterer i ekstrem tørst, plutselig vekttap og løse, gule avføringer. Når en tysk schäferhund har EPI, mottar han ikke næringsstoffer tilgjengelige i maten sin, som kan føre til livstruende undernæring uten behandling. Selv om hunden vil ha denne tilstanden resten av livet sitt, kan den lette håndteres med fordøyelsesenzymer og en bløtkost.
Degenerativ myelopati
Tyske schäferhunder er ofte i risiko for degenerativ myelopati, en sykdom lignende Multippel Sklerose (MS) hos mennesker, hvor det sentrale nervesystemet gradvis ødelegges. Den forekommer hos middelaldrende hunder, og noen hunder viser tegn som snubler over føttene sine. Hunder blir kloddete og svakere over tid og til slutt vil hjernestammen bli påvirket. Denne sykdommen er ofte feildiagnostisert som hofteleddsdysplasi. Eksperter mistenker at denne sykdommen forårsakes av immunsystemet angriper nervene i ryggmargen i hundens midtre rygg. Likt MS, finnes ingen kur men den kan håndteres med fysioterapi, en spesiell kost og kosttilskudd inkludert vitaminer B og E.