For å være beskyttet fra viruser og enkelte bakterielle sykdommer, må hunder vaksineres i spesifikke intervaller for å holde deres immunsystemer kjørende på optimale nivåer. Hunder mottar en serie vaksinasjoner som valper, fordelt på tider utformet for å korrespondere med naturlig forekommende dipp i immunitet. Etter at hunder mottar sin endelige valpe-oppfriskning, vil de fortsette å motta årlige vaksiner resten av livet sitt.
Valpevaksiner
Valper mottar kombinasjonssprøyter bestående av staupe, parvo, coronavirus og leptospirose så tidlig som seks uker og fortsetter hver tredje til fjerde uke til hunden er mellom 16 og 20 uker gammel. De mottar oppfriskere på disse intervallene fordi immunsystemet til hunder, så vel som de fleste andre pattedyr, vil dyppe på de samme tidsmessige intervallene. Vaksinene er utformet for å stimulere immunsystemet og beskytte valpen fra disse potensielt dødelige sykdommene. Valper vil motta en enkelt rabiesvaksine ved 16 ukers alder. Dette samfaller ikke bare med hundens modenhetsnivå, men med statlige og nasjonale lover som styrer administrasjonen av vaksinene. Rabiesvaksiner er påbudt ved lov i alle femti delstater, og i de fleste land rundt jorden, da rabies er overførbar til mennesker.
Voksne vaksinasjoner
Hunder vil motta kombinasjonsvaksinene så vel som en rabies-oppfrisker hvert år resten av livet deres, selv om noen vaksiner anses å være effektive i mye lenger enn ett år. Mange vaksiner som for tiden er tilgjengelige på markedet i dag er anerkjent som effektive i opptil tre år av gangen, likevel, hvis hunden kommer i kontakt med viruspartikler, vil han eller hun være mer sannsynlig å utvikle sykdommen jo lenger det har vært siden han/hun ble vaksinert.
Andre vaksinasjoner
Andre vaksiner anses generelt som valgfrie og har sine egne vaksinasjonsplaner. En av vaksinene er kennelhoste-vaksinen. Mange veterinærer inkluderer denne vaksinen i hundens valpe-oppfrisker og årlige vaksinasjonsprogrammer, men andre gir bare sprøyten til hunder som sannsynligvis vil bli eksponert for viruset. Den intranasale vaksinen anses å være mest effektiv (opptil seks måneder etter vaksinasjon), mens den injiserbare formen kan vare opptil ett år. Borrelia (Lyme disease) vaksiner kan også gis til hunder som er i områder med høy forekomst av flått. Vaksinasjon mot borrelia skjer med en initial serie på to sprøyter gitt to til fire uker fra hverandre og gentatt hvert år med de andre årlige vaksinene.