Boksere gjør gode kjæledyr, men de er utsatt for mange helseproblemer, inkludert potensielt livstruende problemer. Disse problemene kan forverres hvis bokseren ikke får nok fysisk aktivitet eller spiser en kosthold som ikke er næringsrik nok. Ifølge American Boxer Rescue Association, er en av grunnene til at boksere avvikles i dyrehjem er at eiere ikke vil håndtere medisinske kostnader.
Hjerteproblemer
Ifølge «The Veterinarian's Guide to Your Dog's Health», er de mest vanlige hjerteproblemene hos boksere aortastenose (en defekt i aorta-klappen) og atriale anomali (feil i hjertekamrene).
Blodkoagulasjonsproblemer
Boksere er utsatt for to typer blodkoagulasjonsproblemer: Faktor II-mangel (hvor blodet ikke koagulerer) og Faktor VII-mangel, hvor bokseren ikke kan lage en koagulasjonskjemiskstoff kalt protrombin, noe som gjør hunden utsatt for neseblødning.
Fordøyelsesproblemer
Ifølge American Boxer Club, er boksere utsatt for ballongering (bloat, likt kolikk hos hester), pankreatitt og pyloristenose (en magedefekt hvor åpningen for mat er alt for liten).
Flere hunderaser er utsatt for hjernesvulster, og boksere er en av dem. Symptomer inkluderer ikke å kjenne igjen noen, koordinasjonsproblemer og å gå i sirkler.
Døvhet
Ifølge «The Veterinarian's Guide to Your Dog's Symptoms», er alle farger av boksere utsatt for døvhet, men det skjer mestepart til hvite eller mestepart hvite boksere. Døvheten kan være i ett øre eller begge.