Y -kromosomet inneholder et gen kalt SRY -genet, som koder for et protein som er essensielt for mannlig utvikling. SRY -genet er lokalisert på den korte armen til Y -kromosomet, og det er til stede hos alle menn, men ikke hos kvinner.
Når SRY -genet er slått på, utløser det en kaskade av hendelser som fører til utvikling av mannlige reproduktive organer. Disse hendelsene inkluderer dannelse av testikler, produksjon av testosteron og differensiering av de ytre kjønnsorganene til mannlige strukturer.
I fravær av SRY -genet vil embryoet utvikle seg til en kvinne. Dette er fordi det kvinnelige reproduktive systemet er standard utviklingsvei for embryoer. Hos kvinner utvikler og produserer eggstokkene østrogen, og de ytre kjønnsorganene skiller seg ut i kvinnelige strukturer.