Avling av to guppy-søsken sammen er generelt ikke anbefalt. Selv om noen avkom kan virke sunde, er det signifikant høyere risiko for genetiske defekter, misdannelser, og helseproblemer.
Innavling øker sjansen for at avkom arver to kopier av skadelige ressessive gener. Det reduserer også genetisk mangfold, og gjør fry mer sårbare for sykdom og miljøstress. Innavlede guppyer viser ofte redusert fertilitet, mindre størrelse, og saktere vekst.
En bedre tilnærming er å velge urelatert guppyer fra ulike linjer eller avlere. Hvis søsken allerede er avlet, observer fry nøye for misdannelser og vær forberedt på å kule alvorlig påvirkede individer for å beskytte fremtidige generasjoners helse.