Svartknurr rovdes av større fisk som abbor, gedde, gjedde, og torsk; slanger; skilpadder; fugler som hegre og isfugl; og andre svartknurr. Landrovdyre inkluderer vaskebjørn, otter, og diverse fugler og pattedyr. Rovdyre varierer etter sted og svartknurr-størrelse.