Muljør lever i skogøkosystemer samt skogløper, buskland og gressmarker. De foretrekker områder med en blanding av åpen plass og dekke, ofte nær vann. Skogen bak et hus kan gi egnet habitat for mat, skjul og reproduksjon.
Muljør er en nøkkelart i skogøkosystemer, og hjelper med å kontrollere rovdyrepopulasjoner gjennom byttetilgjengelighet og spre frø for å opprettholde plantemangfold. Deres tilstedeværelse er ofte et tegn på et sunt miljø.