Mount Kanchenjunga-regionen er rik på biodiversitet. Dyr funnet der inkluderer:
Pattedyr
Snøleopard, Himalaya-svartbjørn, blåfår, Himalaya-tahr, rød panda, og moskushjort.
Fugler
Himalaya-monal, blodfasan, snøhøne, lammergeier, Himalaya-gribbegrip, og kongeørn.
Kreptdyr
Himalaya-uggemyre, kongekobra, og Tibet-platå-øgle.
Padder
Himalaya-salamander og Tibet-frø.
Ryggstrengsløse
Goliath-bille, Himalaya-honningbi,Påfugl-edderkopp, tusenlegg, tusenlegg.
Tilstedeværelse og fordeling varierer etter høyde, habitat og sesong.