Flere menneskelige aktiviteter har betraktelig bidratt til truingen av svarthavn-ferret:
1. Livsmiljøtap
Den primære årsaken til nedgangen i svarthavn-ferret bestander har vært ødeleggelse av deres prærie-graslivsmiljø. Omforming av disse landene til jordbruk, urbanisering og ressursutvikling har resultert i en betydelig reduksjon i tilgjengelig livsmiljø for præriehund og, subsequent, svarthavn-ferret.
2. Forgiftning
Offisielt støttede rovdyerkontrollprogrammer med mål om å utrydde præriehund involverte ofte bruk av gifter, som stryknin og cyanid. Disse giftene ble påført præriehundhuler og påvirket ofte ikke-målart som svarthavn-ferret, og førte til deres reduserte tall.
3. Sykdom
Sylvatic pest, en sykdom forårsaket av bakterien Yersinia pestis, er smittsom blant svarthavn-ferreter og har forårsaket alvorlige bestandsnedgang. Selv om opprinnelig hjemmehørende i noen områder av Nord-Amerika, ble sykdommen spredt av europeiske bosettere og deres husdyr. Sårbarheten for svarthavn-ferret for pest er en av de største faktorene som begrenser deres gjenopprettelse.
4. Jakt og felling
Svarthavn-ferreter har blitt jaktet og fanget i fortiden, primært for pels. Dette var ikke en betydelig bidragsyter til deres truede status, men det la til den kumulative effekten av andre faktorer.
5. Konkuranse og predasjon
Endringer i prærieøkosystemet, som nedgang i præriehundbestander og inntrengning av ulver, har påvirket svarthavn-ferreter. Ulver og husdyr roveter svarthavn-ferreter, mens reduksjonen av præriehundkolonier påvirker tilgjengeligheten av egnet huler, mat og dekning for ferretene.
Innsats har vært gjort for å bevare og gjenopprette svarthavn-ferret gjennom oppdrettsprogrammer i fangenskap, gjeninnføring og livsmiljøbevaringsinitiativ. Likevel, pga. pågående utfordringer med livsmiljøtap, sykdom og predasjon, forblir arten kritisk truet og sårbar for videre bestandsnedgang.