Reaksjoner på prosedyren
Prosessen med mikrochip-innsetting er like enkel og rutine som en vaksinasjon. En stor nål brukes til å sette inn en silikonchip i den løse huden mellom kattens skulderblad. De fleste katter vil ikke ha noen reaksjon på denne prosedyren, selv om noen kan oppleve bivirkninger lignende en vaksinasjonsinjektion. I sjeldne tilfeller kan det være en liten mengde kløe eller ømhet ved innsettingsstedet, men de fleste katter er upåvirket. Siden katter ikke trenger sedasjon for denne prosedyren, er restitusjonstiden nesten umiddelbar.
Reaksjoner på plassering
Tidlige typer mikrochips hadde tendens til å vandre rundt i dyrets myke vev etter injeksjon. Nylige utviklinger har ført til skapelsen av en sikrere, mer inert mikrochip som blir komfortabelt ved innsettingsstedet. I de fleste tilfeller vil vevet rundt innsettingen vokse rundt chippen, sikrende at den blir på plass. Vandrering av mikrochips er hovedsakelig en bekymring på grunn av muligheten at den ikke vil bli skannet riktig av dyrevelferdsorganisasjoner. Likevel kan vandrering av chippen også forårsake ubehag og avstøtning hos katter. Fordi mikrochips nå er laget av et biokompatibelt materiale, er de mer sannsynlige å binde til mykvevet og bli på plass, forhindre infeksjon og avstøtning.
Fibrosarkom
Fibrosarkom er en sjelden kreft som kan oppstå i et husdyrs myke vev ved enhver innsettingssted. På grunn av deres størrelse og typen vaksiner de krever, er katter mer sannsynlige å utvikle innsettingsrelatert fibrosarkom enn større husdyr. Forskning har indikert at innsettingsrelatert fibrosarkom er knyttet mest til bruk av visse veslefeber- og felin leukemia-vaksiner, selv om stedet for enhver injeksjon kan bli en kilde til kreft. De fleste katter som utvikler fibrosarkom har en genetisk predisponering for kreft, og mange vaksiner er korrigert for å tillate lavest mulig forekomst av kreft.