Innendørskatter kan fortsatt bli utsatt for virus, bakterier, og parasitter bragt inn av mennesker, andre kjæledyr, eller gjennom åpne vinduer og dører. Vanlige sykdommer inkluderer øvre respirasjonsinfeksjoner, gastrointestinalinfeksjoner, hudinfeksjoner, og øyeinfeksjoner. De kan også utvikle aldersrelaterte sykdommer som kreft, hjerte- og karsykdommer, og diabetes.
For å holde innendørskatter friske, oppretthold vaksinasjoner, gi en ren kasse, mat med høy kvalitet, og planlegg regelmessige veterinærkontroller.