Habitatforstyrrelse
Sjøhester er avhengige av korallrev og tangskoger for skjul, mat og reproduksjon. Disse habitatene ødelegges av kystutbygging, forurensning og overfiske, noe som etterlater sjøhester uten hjem.
Overfiske
Sjøhester fanges for mat, tradisjonell medisin og akvariumhandelen. Etterspørselen driver bestandsnedgang verden over.
Klimaendringer
Stigende havtemperaturer forårsaker korallbleking og habitatforstyrrelse. Ekstreme værhendelser som orkaner skader også sjøhestehabitater.
Forurensning
Forurensning fra avløp, gjødsel og pesticider forurenser sjøhestehabitater og gjør overlevelse vanskelig.
Bifangst
Sjøhester fanges ofte uavsiktlig i fiske nett som retter seg mot andre arter. Bifangst dreper store mengder og utgjør en stor trussel.
Menneskelig nysgjerrighet og interaksjon
Interaksjon og sampling av mennesker kan forårsake stress og dødelighet, spesielt når sjøhester tas fra sitt habitat for forskning eller holdes som kjæledyr.