Det er usannsynlig at rotter og mus får det til å gå bra sammen i samme miljø. Selv om de begge er gnagere og deler noen likheter, har de distinkte sosiale strukturer og atferd som ofte fører til konflikt.
Konkurranse om ressurser: Både rotter og mus er svært konkurranseutsatte for mat, vann og bolig.
Territorialitet: Begge arter er svært territoriale, og hanner vil bråmot forsvar sitt territorium mot inntrengere.
Rovdyre-bytte-forhold: Rotter er større og mer aggressive enn mus. I noen tilfeller kan rotter se mus som bytte angripe dem.
Forskjellige sosiale strukturer: Rotter lever i store, komplekse sosiale grupper, mens mus tenderer å leve i mindre, mer løst strukturerte grupper.
Unntak: Unge dyr kan være mer tolerante, og i kontrollerte miljøer som dyrparker eller laboratorier, kan de sameksistere hvis de introduceres forsiktig med tilstrekkelig plass og ressurser.
Hele tatt, mens rotter og mus av og til kan dele rom, er det usannsynlig at de blir sanne venner. Deres naturlige instinkter og konkurranse om ressurser gjør konflikt mer sannsynlig enn samarbeid.