Galápagosøyene står overfor trusler fra introduserte arter, overfiske, klimaendringer, turisme, forurensning og befolkningsvekst. Vernearer fokuserer på kontroll av invasive arter, bærekraftig fiske, klimatiltak, ansvarlig turisme, forurensningskontroll og befolkningsstyring for å beskytte øvenes unike biodiversitet.