- Klimaendringer :Klimaet under Miocene og Pliocene -epokene, da Megaladons trivdes, var mye varmere enn i dag. Da klimaet avkjølte seg under Pliocene- og Pleistocene -epokene, ble havene kaldere, og Megalodons foretrukne byttedyr, som hvaler og seler, flyttet til varmere farvann. Dette kan ha fått megalodonet til å miste matkilden og til slutt bli utryddet.
- konkurranse :Megalodonet var den største haien som noensinne har bodd, men det var ikke den eneste gigantiske haien i havet under Miocene og Pliocene -epokene. Andre store haier, for eksempel den store hvithaien og Tiger -haien, kan ha konkurrert med Megalodon om mat og ressurser, og kan ha bidratt til utryddelsen.
- Menneskelig jakt :Noen forskere mener at mennesker kan ha bidratt til utryddelsen av Megalodon. Mennesker begynte å jakte hvaler og andre store marine pattedyr under Pleistocene -epoken, og dette kan ha redusert Megalodons matforsyning. I tillegg kan mennesker ha direkte jaktet megaladoner etter mat eller fordi de ble sett på som en trussel.
- En kombinasjon av faktorer :Det er sannsynlig at en kombinasjon av faktorer, som klimaendringer, konkurranse og menneskelig jakt, bidro til utryddelsen av megalodonet.
Megaladons ble utdødd for rundt 2,6 millioner år siden.