Prosessen med guanoformasjon begynner med fuglene eller flaggermus som konsumerer fisk, insekter eller frukt. Når de fordøyer maten, blir næringsstoffene absorbert i kroppene sine, og avfallsproduktene skilles ut som guano. Guano faller ned på bakken eller samler seg på avsatser og sprekker i koloniene. Over tid akkumuleres guano og danner tykke lag som kan nå dybder på flere meter.
Guano er høyt verdsatt som gjødsel på grunn av det høye næringsinnholdet. Det brukes ofte i organisk jordbruk og hagearbeid for å gi viktige næringsstoffer for planter. På grunn av overutnyttelse av guanoforekomster i det siste, har noen guanoproduserende områder imidlertid blitt tømt, noe som fører til bevaringsinnsats for å beskytte disse verdifulle ressursene.