Tegn på paring hos dverg-hamstre inkluderer forfølging, montering, hofte-støt, penis-inntroduksjon, ejakulasjon, og etter-samleie-stell.
Dverg-hamstre kan pare seg så tidlig som 6 uker, har flere estrus-sykluser årlig, og er mest fruktbare tidlig i syklusen. Graviditet varer 16 til 21 dager, med kull på 4 til 8 unger.