Pattedyrspirasjon
Som alle pattedyr puster flaggermus ved å innhale luft og utskille karbondioksid. De har lunger og et midede, og deres respirasjonssystem fungerer likt som hos andre pattedyr.
Tilpasninger for flyving
Flaggermus har en høy metabolsk rate og krever store mengder oksygen for å drive flyving. De puster raskere enn mange andre pattedyr, og lungene deres er relativt store for kroppsstørrelsen. En spesiell tilpasning kalt naseventil hjelper med å regulere luftstrøm under flyving og forhindrer luft fra å flyte tilbake ut av nesen.
Pusteprosessen
Når en flaggermus innhaler, går luften inn gjennom nesehullene og passerer naseventilen inn i trakea og lunger. Små luftboble-alveoler lar oksygen diffusere inn i blodstrømmen mens karbondioksid beveger seg ut. Luften forlater så trakea og nesehullene.
Takk vare sine kraftige lunger og effektive respirasjonssystem, kan flaggermus opprettholde høyt oksygenforbruk selv under lange, anstrengende flyvninger.