Sukkerflyere har flere naturlige fiender i sitt opprinnelige habitat:
Rovfugler: Ugler og høker jakter sukkerflyere med skarpe klor og utmerket syn.
Sler: Større arter som pythoner og goannaer bruker kvessing for å fange sukkerflyere.
Større pungdyr: Kvoller og tasmaniske djævler har sterke kjever og skarpe tenner i stand til å angripe sukkerflyere.
Dingoer: Ville australiske hunder jakter små pattedyr, inkludert sukkerflyere.
Sukkerflyere har tilpasninger for å redusere disse truslene. De er nattaktive og trelevende, tilbringer mesteparten av tiden i trær, og strever på vendingsevne og gliding for å unngå fare. I fangenskap er de generelt ikke utsatt for disse rovdyrene, men krever likevel et trygt miljø.