Wisconsin har tapt flere arter, inkludert:
- Østlig hellbender (_Cryptobranchus alleganiensis alleganiensis_): En salamander nå ansett som utryddet lokalt pga. habitattap og forurensning.
- Vandredue (_Ectopistes migratorius_): En gang vanlig i Wisconsin, drevet til utryddelse i slutten av 1800-tallet av overjakt og habitattap.
- Stor alke (_Pinguinus impennis_): En flyveevne løkefugl jaktet til utryddelse midt på 1800-tallet for fjær og kjøtt.
- Eskimo-klire (_Numenius borealis_): En snype jaktet til utryddelse i slutten av 1800-tallet.
- Carolina-parakitt (_Conuropsis carolinensis_): En fargerik fugl jaktet til utryddelse i tidlig 1900-tallet.
- Østlig puma (_Puma concolor couguar_): Utryddet lokalt i tidlig 1900-tall pga. jakt og habitattap.
- Skogsmuskoks (_Symbos cavifrons_): En pleistocen megafauna-art utryddet for ca. 10 000 år siden.
- Pleistocen bison (_Bison antiquus_): Den største kjente bisonen, utryddet for ca. 10 000 år siden.
- Mastodon (_Mammut americanum_): En ikonisk istids-pattedyr utryddet for ca. 10 000 år siden.
- Ullhåret mammut (_Mammuthus primigenius_): En istidsart utryddet for ca. 10 000 år siden.