Jakt
I over 150 år ble havørter jaktet for deres priset pels. Tidlig 1900-tallet var det kun noen hundre igjen i isolerte pommer.
Habitattap
Havørter avhenger av tare-skoger for mat og skjul. Tare-skoger forsvinner på grunn av forurensning, klimaendringer og overgrazing av sjøuriner.
Forurensning
Oljeutslipp, avløp og annen forurensning forurenser vann og matkilder, forårsaker sykdom og død. Forurensning skader også tare-skoger.
Predasjon
Haier, spekkhogger ogørn rovter av og til på havørter, men utgjør vanligvis ikke en betydelig trussel.
Sykdom
Havørter er mottagelige for bakterielle, virale og parasitære sykdommer som kan være dødelige, spesielt for unge ørter.
Klimaendringer
Stigende havtemperaturer får tare-skoger til å avta. Smeltende is reduserer habitat og øker sårbarhet for stormer.