Naturlige årsaker
Som alle levende skapninger, står ekorner overfor en rekke naturlige trusler.
Alder: I vilt tilstand lever ekorner typisk mellom 5 og 10 år, selv om noen kan overleve lenger.
Sykdom: Sykdommer som veslefeber, hundepest, og ekornpox kan påvirke ekornbestander.
Parasitter: Indre og ytre parasitter kan svække ekorner og, i alvorlige tilfeller, vise seg dødelig.
Sult: Hårde vinterer og matmangel kan føre til sult.
Rovdyr
Ekorner jeges av mange rovdy:
Rovfugler: Våkere, ugler, og andre rovfugler jakter ekorner fra luften.
Markrovdyr: Kojotter, rever, og rødlynx jakter ekorner på bakken.
Snoger: Noen arter, inkludert gartersnoger, rovler unge ekorner.
Huskatter: Utekatter kan utgjøre en alvorlig fare for ekorner.
Menneskeskapte årsaker
Kjøretøyer: Biler er en hyppig årsak til ekorndød, spesielt i byområder.
Gift: Rottgift ment for andre skadedyr kan uavsiktlig drepe ekorner.
Feller: Ekorner kan felles for bestandsregulering, pelshandel, eller andre grunner.
Habitattap: Utbygging og avskoging krymper tilgjengelig habitat og øker sårbarhet.
Andre årsaker
Ulykker: Fall fra høyder, innfengning, og andre uhell kan være dødelig.
Ekstremt vær: Alvorlig kulde eller varme kan overvelde et ekorns evne til å overleve.
Ekorner spiller en viktig rolle i økosystemer ved å spre frø og bistå bestøvning. Hvis du finner en syk eller skadet ekorn, er det best å kontakte en viltrehabiliterer.