Den optimale pH-verdien i magen er svært syrlig, typisk mellom 1 og 2. Denne syregraden er essensiell for å aktivere pepsin, enzymet som bryter ned proteiner, og for å denaturere proteiner for å gjøre dem enklere å fordøye.
Den lave pH-verdien hjelper også med opptak av næringsstoffer som jern og vitamin B12 og beskytter mot patogener ved å drepe de fleste bakterier og mikroorganismer. Magen tåler denne syregraden gjennom et beskyttende slime-lag og bikarbonatsekretion.
Avvik fra optimal pH, som lav eller fraværende magesyre, kan forringe fordøyelse og øke infeksjonsrisiko.