Flundre tilhører Rike Animalia. Deres fulle klassifisering inkluderer stamme Chordata, klasse Actinopterygii (strålefinnede fisker), og orden Pleuronectiformes, som er flundre-ordenen.
Det finnes ikke et eget rike spesifikt for flundre; som alle dyr er de plassert innenfor Animalia.