Appalachian-elver er hjemsted for abbor (smallmouth, largemouth, redeye), solfisk (blågill, redear, grønn solfisk, pumpkinseed, longear), metallelur (kanal, blå, flathead, bullheads), ørret (regnbue, brun, brook), og andre arter som glasøye, sauger, amerikansk ål, karp, sildegjedde, dace og bekkegjørs.