Elvemunninger er sårbare på grunn av flere kryssende sårbarheter:
- Forurensningssensitivitet: blandingen av ferskvann og saltvann får forurensninger til å bestå og akkumulere.
- Habitatendring: draging, landoppfylling og utbygging ødelegger vitale habitat.
- Overfiske: ubaerekraftig høsting utarmer fisbestander og oppdrettsområder.
- Ressursutvinning: utvinning av sand, grus eller olje forstyrrer fysisk struktur og strømning.
- Klimaendringer: havnivåstigning, forsuring og salinitetsskift destabiliserer økosystemet.
Å beskytte elvemunninger krever omfattende forvaltning, vern og bærekraftige praksiser.