De to store akvatiske systemene er:
1. Ferskvannssystemer: Innsjøer, elver, bekker, dammer, våtmarker og grunnvann med lav saltkonsentrasjon (mindre enn 1%).
2. Marine systemer: Hav, sjøer, korallrev og elvemynninger med høy saltkonsentrasjon (rundt 3,5%).