«Havaborre» refererer til mange arter, så trusselsgrunner varierer, men vanlige faktorer inkluderer:
Overfiske: Høy etterspørsel, lang levetid, svekst, og redskap som fanger ungfisk gjør havaborre sårbare.
Habitattap og nedverding: Kystutbygging, forurensning, og klimaendringer skader revhabitater.
Andre faktorer: Sykdom og predasjon kan ytterligere belaste populasjoner.
Arter som guløyet havaborre og bocaccio har blitt alvorlig overfisket. Bevaringstiltak inkluderer fangstbegrensninger, marine vern områper, og pågående forskning.