Cairns-regnbuefisken (Melanotaeniidae) er for tiden ikke listet som truet.
Likevel er enkelte arter innen regnbuefiskfamilien truet eller utsatt for utryddelse. Potensielle trusler inkluderer:
Habitattap og nedfall fra hogst, jordbruk, urban utvikling og forurensning.
Innførte arter som konkurrerer om ressurser eller introduserer sykdommer.
Overfiske av andre arter kan forstyrre økosystemer og påvirke regnbuefisk.
Klimaendringer som endrer temperatur, nedbør, gytecyklusser og habitatsikkerhet.
Spesifikke trusler varierer etter art og region. Å beskytte naturlige habitater og møte disse presset er avgjørende for bevaring.