Brunaure er bytte for mange dyr:
Akvatiske predatorer: Større ørret, gedde, gjedde, abbor, muskellunge, kattfisk, fiskeørn, isfugl, hegre, toppskjeggand, oter, mink, vaskebjørn, og store akvatiske insekter.
Landpredatorer: Bjørner, rever, høker, ørner, og ugler.
Andre trusler: Sykdom og forurensning kan svekke ørret, og gjøre dem mer sårbare.
Predatorer varierer etter lokasjon og miljø.